2012 年上半年，松花江水系为中度污染，主要污染指标为化学需氧量、劣Ⅴ类占 20.0%。与上年同期相比，Ⅰ～Ⅲ类水质断面比例上升了20个百分点，水质有所好转。
松花江干流为轻度污染主要污染指标为氨氮、化学需氧量和五日生化需氧量。11 个国控断面中，Ⅰ～Ⅲ类水质断面占 54.5%,无劣Ⅴ类水质断面。与上年同期相比，Ⅰ～Ⅲ类断面比例提高 18.1个百分点，水质有所好转。
松花江支流为中度污染，主要污染指标为氨氮、总磷和高锰酸盐指数。14 个国控断面中，Ⅰ～Ⅲ类水质断面占 50.0%，劣Ⅴ类占35.7%。与上年同期相比，Ⅰ～Ⅲ类断面比例提高 21.4 个百分点，水质明显好转。
松花江省界河段为轻度污染，主要污染指标为氨氮。6 个省界断面中，Ⅰ～Ⅲ类水质断面占 66.7%，无劣Ⅴ类水质断面。与上年同期相比，Ⅰ～Ⅲ类断面比例提高 16.7 个百分点，水质有所好转。